Pintu air ini digagas oleh insinyur asal Belanda Herman van Breen. Dalam rangka membebaskan Batavia dari banjir tahun 1918.
Meski banjir tetap terjadi hingga saat ini, peran Pintu Air Manggarai tetap vital. Pintu Air Manggarai mengalihkan air ke bagian luar Jakarta melewati Banjir Kanal Barat sampai ke Muara Angke di pantai utara.
